どうやって固定化する？シリーズ ①
フラグメント・低分子のBinding screen

質問

分子量30 kDaのタンパク質を固定化し、添加アナライトとして1,000種類の化合物（フラグメント・低分子）の測定を行うBinding screenを実施したいと思います。

この場合、リガンドの固定化方法は、下記の3つのうち、どの方法を選択したらいいでしょうか？

考え方のポイント

この実験系では頻繁にリガンドの付け替えが必要でしょうか？

答え

Biotin-センサーチップSA/NAにてリガンドを固定化します。

解説

リガンドとなる分子量 30 kDaのタンパク質をビオチン化し、センサーチップSA（またはセンサーチップNA）に固定化します。

今回のケースでは、リガンドとなるタンパク質が1種類であること、アナライト数が1,000と多く、フラグメント・低分子であることがポイントです。通常、フラグメントや低分子は解離速度が速いことが多いため、アナライト添加後のリガンドの再生が不要なことが多く、速やかに次のサンプルの測定に進みます。この系は典型的なフラグメント・低分子のBinding Screenで使われます。

【参考】Binding screenとは？

Binding screenでは、通常、アナライト濃度1点で複数の検体を測定します。得られた測定結果についてフィッティングせず、結合レスポンスの高さで評価します。