東京大学大学院
医科学研究所
津本 浩平 先生

実践編-4：フラグメントライブラリーの測定におけるSPR/ITC戦略の実効性と効率的活用法（1）

目次

1. はじめに（当ページです）
2. フラグメントスクリーニングにおけるSPR測定の注意点
3. 選出されたフラグメントのITCを用いた効率の良いヒットバリデーション法とエンタルピーランキング法（competitive SITE法）

はじめに

前回はバイオ医薬品のお話しでしたが、今回から2回にわたって再び低分子医薬品の評価法をテーマにしたいと思います。今回はまず、上記の1～3までをお話し、次回実験例のご紹介とまとめをお話ししたいと思います。

第7回の抗体医薬開発の技術革新～物理化学、計算科学との融合～でも少しだけ触れましたが、最近、300 Da以下の低分子量の化合物（フラグメント化合物）からなるライブラリーから、低アフィニティー（例えばKD値が数100 µMや時にはmMオーダー）のヒット化合物を選出し、これを出発点として低分子医薬品を設計していくFragment-Based Drug Discovery（FBDD）という方法があります。この方法で用いるライブラリーは一般的に1000～10000化合物程度と従来に比べて非常に少ないにも関わらず、分子量が小さいために化合物構造の多様性（ケミカルスペース）をまんべんなくカバーすることができます。そのため、得られた選出化合物に、構造情報・相互作用情報・計算科学などの情報を密接に連携させながら合成展開することで、最適な構造を逃すことなく、有効な化合物を生み出すことが期待できると考えられています。

さて、フラグメント化合物と言っても一般的なリード化合物と比べて、アフィニティーが低くて、分子量がせいぜい1/3～半分くらいになるだけです。これを測定するのに今までの化合物測定と何が違うのでしょうか？実はかなり気をつけなければいけない点が出てくるのです。

今回はまずフラグメント化合物をSPRとITCで測定するために気をつけなければいけないこと、さらに効率的に測定するためにはどうすれば良いのか？ということの概略をお話ししたいと思います。そして、次回はいよいよそれらを考えたうえでのフラグメントスクリーニングの実例についてご紹介します。

次へ（フラグメントスクリーニングにおけるSPR測定の注意点）

お問合せフォーム

※日本ポールの他事業部取扱い製品（例: 食品・飲料、半導体、化学/石油/ガス ）はこちらより各事業部へお問い合わせください。