東京大学大学院
医科学研究所
津本 浩平 先生

連載「相互作用解析の王道」を終えるにあたって
～3年間を振り返って、そしてこれから～

4. 相互作用解析の未来
4-1　トータルコーディネーションが必要になってきた

津本：熱力の平衡論的な最初と最後ということに関しては、方法論的にかなり確立してきました。自分でタンパク質を作って、変異体を作って、解析するというながれは一般化してきましたが、kon, koffを単純に求めるのではなくて、その結合の途中で何が起こっているのかを記述しようという流れになっています。

知也：コンフォメーション変化とか。

津本：そうそう。あるいは低分子側も実はリンカーがつながっていたら、リンカーの全くない板状という薬はないので、どこかでつながっていますよね。
メチレンの2個とか、そのメチレンの動きという低分子単品での議論はされてきましたけど、そこの熱力学をタンパク質と絡めて議論しなければいけない。低分子が水の中でどういう状態にいてという理解と、タンパク質のポケットの中でどういうふうに振る舞うかという理解をしていかなければいけない。そうなると、情報科学がいよいよ入ってくる。

知也：夢みたいですね。現実になってきたわけですね、20年かかって。

津本：そうそう、いよいよなってきた。そういう技術革新が、あったと思う。しかもそれは我々の同世代の人たちが授業で習ってきたような、黒板を写して、こういうふうになるよといわれていたことが、今、そこで若い人たちがキーボードを叩いて実際にやっているという時代になってきていると。なので、これまでに開発され進展してきている相互作用の解析が、これからの前提になって、さらにそこからどうするの？ということが求められるでしょうね。
だから、新しい技術・原理という意味においては、現状、オルタナティブになるような方法が出てきているというわけではないと思いますね。むしろ、この場合はこういう手法のほうがよいのでは、という提案が当面続くと思います。原理に関しては、決定的に新しいのがなくて、FRETならこうできる、このプローブならこうです、共焦点はここで良くなった、いろんな改善があったということになると思うんです。これから新しい技術、原理というよりは、それをいかに使いこなすかということだと思いますね。

知也：具体的に仕事の仕方として、スパコンや計算化学と実際のウェットな実験は、どういう流れで進んでいくのでしょう。

津本：クロストークだと思います。Cross-validationで行き来する時代だと。in silicoで設計して、合成した分子をウェットで確認して終わり、ということではなくて、これからは、ウェットの結果をin silico側にフィードバックして、設計を改善して、というサイクルを回すことになるでしょう。だから、一つのチームでできるというより、複数のコンソーシアムみたいな中で仕事を進める必要が出てきます。そうなってくると、例えば製薬企業は強いですね、社内でできるので。問題はその人たちが、縦割りの部署で別々にやるのでなくて、一緒になってやれるかどうか。

太蔵：横串チームがつくれるかどうかということですね。

津本：そうです。いずれ、そうなってくると思います。実際、うまくいっているなという話を聞くところは、横串的にサーッといけているところが多いです。
なので、おのおの専門性は相変わらず残っているにしても、例えば結晶をやっている人は計算もやるとか、結晶だったらプリパレーションできる人は、じゃBiacore™・ITCもとかいうようなものが確実に流れていて、一番大きな流れで最近感じているのは、細胞とかvivoですね。動物を使っていた人たちが、タンパクをとって解析してみようかしら、という流れは確実にできていると思う。

太蔵：それは製薬会社のほうですか。

津本：ですね。アカデミアではなくて。
アカデミアはもちろん動物は動物、vivoを使って究めていきますけど、現実に自分たちは速度論的な理解が、好き嫌いはともかく、欠かせなくなっています。だから、相互作用解析はすたれることは絶対なくて、今後ますます使われるようになります。そして、それは他の方法とのCross-validationになる。これまでそれを提唱してきたけれど、これから5年はそれを実際に応用していくと思うんです。
そういう意味では、要素技術が成熟してきている中で、目的に応じてどう組み合わせるかというようなところが各社、各アカデミアに求められているのかなという気がいたします。

太蔵：まさに最近流行っている、ソリューションとか、そういうことですね。

津本：そうそう。そういう意味では、トータルコーディネーションが必要になってきたと思うんです。

 

創薬が今イノベーションを受けているという状態だと思いますね

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